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제 1장
게놈해석을 뒷받침하는 informatics 1
1 ●게놈배열의 결합편집과 annotation(주석) 大山 彰 2
1. 머리말 2
2. 염기배열 결합편집에서 annotation까지 3
3. 플라그멘트 결합편집(assemble) 5
4. annotation 12
5. 맺음말 17
2 ●QTL (Quantitative Trait Locus) 해석 中谷明弘 19
1. 머리말-QTL 해석이란 19
2. QTL 해석의 이론적 배경 19
3. 실제 데이터의 해석결과 29
4. 맺음말 41
3 ● 프로테옴 해석과 2D-PAGE 화상처리 高橋勝利 43
1. 머리말 43
2. 프로테옴 해석을 뒷받침하는 기술 45
3. 프로테옴을 위한 2D-PAGE 지도 해석 53
4. 새로운 개념에 근거한 2D-PAGE 화상처리 시스템 57
5. 맺음말 64
제 2장
게놈정보에 근거한 기능 예측 69
1 ●게놈염기배열의 주석 -유전자의 구성·기능 예측 中村保一 70
1. 머리말 70
2. 게놈염기배열에서의 일차 주석 작성 71
3. 맺음말 81
2 ●경로로부터의 게놈 기능 예측 五斗 進 84
1. 머리말 84
2. 게놈에서 경로정보를 추출한다 86
3. 게놈정보에서 경로정보로 91
4. 경로로부터의 기능 예측 93
5. 맺음말 97
3 ●단백질 입체구조에 근거한 게놈 기능 예측 由良 敬 100
1. 단백질 입체구조에 근거한 기능이란 무엇인가 100
2. 구조 제노믹스의 구성 105
3. 단백질의 입체구조를 예측한다 106
4. 맺음말 113
제 3장
게놈진화/비교게놈학 117
1 ● 게놈진화 渡邊日出海 118
1. 머리말 118
2. 게놈배열의 진화학적 해석 120
3. 직계와 측계 123
4. 도메인 구조와 그 분해 125
5. 선조 생물종이 가지고 있던 유전자 세트의 추정과 유전자의 생사 27
6. 게놈구조의 재구축 130
2 ● 컴퓨터 해석에 의한 번역개시 영역의 비교게놈학 齋藤輪太郞 134
1. 머리말 134
2. 번역개시에 대해서 135
3. 번역개시 시그날의 비교 135
4. 번역개시 부위의 인식방법의 비교 139
5. 맺음말 145
제 4장
게놈정보에 근거한 생명의 시스템적 이해 147
1 ● 대사계의 재구축 有田正規 148
1. 머리말 148
2. 종래의 대사해석 150
3. 열린 계의 해석 156
4. 맺음말 161
2 ●S-system에 의한 유전자의 상호작용 추정 罔本正宏 165
1. 머리말 165
2. S-system 모델 166
3. 탐색 알고리즘 168
4. 소규모의 유전자 네트워크의 상호작용 추정 172
5. 대규모의 유전자 네트워크의 상호작용 추정을 위해서 175
6. 앞으로의 전망 186
3 ●세포 전체의 컴퓨터 시뮬레이션을 위해서 中山洋一, 富田 勝 189
1. 머리말 189
2. 세포의 과정 190
3. 대사회로의 시뮬레이션 192
4. 시그날 전달경로와 유전자 발현 제어의 시뮬레이션 196
5. 세포 전체의 시뮬레이션 197
6. 맺음말 202
●용어 해석 목차 프로테옴(proteome) 67
2D-PAGE 67
매트릭스지원 레이저탈리 이온화-비행시간형질량분석
(MALDI-TOFMS) 67
ORF (open reading frame) 146
보효소 (coenzyme) 164
선형계획법 (linear programing) 164
그래프 (graph) 164
대사제어해석 (metabolic control analysis) 205
유전적 알고리즘 (genetic algorithm;GA) 205
무게행렬법 (weight matrix) 205
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포스트게놈 시대의 생물정보학 |
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